MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV4

Total Repeats: 786

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015188	TGC	2	6	24751	24756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169029
502	NC_015188	CA	3	6	24765	24770	50 %	0 %	0 %	50 %	325169029
503	NC_015188	TCC	2	6	24827	24832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325169029
504	NC_015188	GGA	2	6	24840	24845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325169029
505	NC_015188	CAC	2	6	24852	24857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325169029
506	NC_015188	GAGG	2	8	24909	24916	25 %	0 %	75 %	0 %	325169029
507	NC_015188	CG	3	6	24926	24931	0 %	0 %	50 %	50 %	325169029
508	NC_015188	TGC	2	6	24975	24980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169029
509	NC_015188	GTC	2	6	24989	24994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169029
510	NC_015188	AGCC	2	8	24997	25004	25 %	0 %	25 %	50 %	325169029
511	NC_015188	TGA	2	6	25069	25074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325169029
512	NC_015188	CCG	2	6	25103	25108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169029
513	NC_015188	CAT	2	6	25109	25114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325169029
514	NC_015188	TATCC	2	10	25125	25134	20 %	40 %	0 %	40 %	325169029
515	NC_015188	TCGCT	2	10	25142	25151	0 %	40 %	20 %	40 %	325169029
516	NC_015188	GAG	2	6	25187	25192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325169029
517	NC_015188	TCATC	2	10	25249	25258	20 %	40 %	0 %	40 %	325169029
518	NC_015188	TCA	2	6	25314	25319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325169029
519	NC_015188	CGA	2	6	25330	25335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169029
520	NC_015188	TTC	2	6	25431	25436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325169029
521	NC_015188	CGA	2	6	25525	25530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169029
522	NC_015188	TCC	2	6	25541	25546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325169029
523	NC_015188	ATCCA	2	10	25674	25683	40 %	20 %	0 %	40 %	325169029
524	NC_015188	TGC	2	6	25689	25694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169029
525	NC_015188	TC	3	6	25808	25813	0 %	50 %	0 %	50 %	325169029
526	NC_015188	TTC	2	6	25818	25823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325169029
527	NC_015188	CG	3	6	25848	25853	0 %	0 %	50 %	50 %	325169029
528	NC_015188	GAA	2	6	25982	25987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325169029
529	NC_015188	TAT	2	6	26005	26010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325169029
530	NC_015188	CGC	2	6	26035	26040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169029
531	NC_015188	GTG	2	6	26070	26075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325169029
532	NC_015188	AAC	2	6	26093	26098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325169029
533	NC_015188	CTT	2	6	26183	26188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325169029
534	NC_015188	TCC	2	6	26259	26264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325169029
535	NC_015188	CAG	2	6	26288	26293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169029
536	NC_015188	TGG	2	6	26371	26376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325169029
537	NC_015188	GAA	2	6	26384	26389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325169029
538	NC_015188	TGT	2	6	26410	26415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325169029
539	NC_015188	AT	4	8	26451	26458	50 %	50 %	0 %	0 %	325169029
540	NC_015188	TG	3	6	26468	26473	0 %	50 %	50 %	0 %	325169029
541	NC_015188	CGC	2	6	26514	26519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169029
542	NC_015188	AGA	2	6	26520	26525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325169029
543	NC_015188	GTC	2	6	26582	26587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169029
544	NC_015188	AAG	2	6	26669	26674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325169030
545	NC_015188	AGC	2	6	26694	26699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169030
546	NC_015188	GCCGGC	2	12	26711	26722	0 %	0 %	50 %	50 %	325169030
547	NC_015188	CGG	2	6	26838	26843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325169030
548	NC_015188	TGG	2	6	26845	26850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325169030
549	NC_015188	GGCC	2	8	26983	26990	0 %	0 %	50 %	50 %	325169030
550	NC_015188	GGCT	2	8	27018	27025	0 %	25 %	50 %	25 %	325169030
551	NC_015188	GAAC	2	8	27037	27044	50 %	0 %	25 %	25 %	325169030
552	NC_015188	CCG	2	6	27048	27053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169030
553	NC_015188	GCG	3	9	27057	27065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325169030
554	NC_015188	TGG	3	9	27067	27075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325169030
555	NC_015188	CCTTGC	2	12	27115	27126	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325169030
556	NC_015188	AGCC	2	8	27281	27288	25 %	0 %	25 %	50 %	325169030
557	NC_015188	CCAG	2	8	27292	27299	25 %	0 %	25 %	50 %	325169030
558	NC_015188	GCCTCG	2	12	27321	27332	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325169030
559	NC_015188	CCA	2	6	27342	27347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325169030
560	NC_015188	GC	3	6	27356	27361	0 %	0 %	50 %	50 %	325169030
561	NC_015188	CCT	2	6	27364	27369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325169030
562	NC_015188	GC	3	6	27380	27385	0 %	0 %	50 %	50 %	325169030
563	NC_015188	GTCG	2	8	27473	27480	0 %	25 %	50 %	25 %	325169030
564	NC_015188	CGG	2	6	27562	27567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325169030
565	NC_015188	CGC	2	6	27676	27681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169030
566	NC_015188	GC	4	8	27713	27720	0 %	0 %	50 %	50 %	325169030
567	NC_015188	TCG	2	6	27729	27734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169030
568	NC_015188	CCAT	2	8	27741	27748	25 %	25 %	0 %	50 %	325169030
569	NC_015188	CCA	2	6	27769	27774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325169030
570	NC_015188	CGC	2	6	27803	27808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169030
571	NC_015188	GAT	2	6	27893	27898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325169030
572	NC_015188	ATC	2	6	27929	27934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325169030
573	NC_015188	CGG	2	6	27953	27958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325169030
574	NC_015188	CGA	2	6	28160	28165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169031
575	NC_015188	ATT	2	6	28171	28176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325169031
576	NC_015188	TC	3	6	28184	28189	0 %	50 %	0 %	50 %	325169031
577	NC_015188	GCTT	2	8	28208	28215	0 %	50 %	25 %	25 %	325169031
578	NC_015188	TAC	2	6	28256	28261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325169031
579	NC_015188	TTC	2	6	28280	28285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325169031
580	NC_015188	GTA	2	6	28359	28364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325169031
581	NC_015188	ACC	2	6	28493	28498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325169031
582	NC_015188	T	6	6	28500	28505	0 %	100 %	0 %	0 %	325169031
583	NC_015188	GCC	2	6	28562	28567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169031
584	NC_015188	CGA	2	6	28583	28588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169031
585	NC_015188	GCG	2	6	28595	28600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325169031
586	NC_015188	GCG	2	6	28754	28759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325169031
587	NC_015188	TCG	2	6	28769	28774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169031
588	NC_015188	TGCT	2	8	28870	28877	0 %	50 %	25 %	25 %	325169031
589	NC_015188	GTCG	2	8	28886	28893	0 %	25 %	50 %	25 %	325169031
590	NC_015188	TGA	2	6	29000	29005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325169031
591	NC_015188	GCA	2	6	29028	29033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169031
592	NC_015188	GCAAT	2	10	29161	29170	40 %	20 %	20 %	20 %	325169031
593	NC_015188	TGC	2	6	29174	29179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169031
594	NC_015188	ACT	2	6	29186	29191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325169031
595	NC_015188	CTG	2	6	29226	29231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169031
596	NC_015188	GAA	2	6	29265	29270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325169031
597	NC_015188	AGCTT	2	10	29277	29286	20 %	40 %	20 %	20 %	325169031
598	NC_015188	CAG	2	6	29535	29540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169032
599	NC_015188	CG	3	6	29541	29546	0 %	0 %	50 %	50 %	325169032
600	NC_015188	GGCT	2	8	29558	29565	0 %	25 %	50 %	25 %	325169032
601	NC_015188	GTG	2	6	29655	29660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325169032
602	NC_015188	CTG	2	6	29703	29708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169032
603	NC_015188	ACG	2	6	29778	29783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169032
604	NC_015188	CCGG	2	8	29784	29791	0 %	0 %	50 %	50 %	325169032
605	NC_015188	AGC	2	6	29873	29878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169032
606	NC_015188	GC	3	6	29883	29888	0 %	0 %	50 %	50 %	325169032
607	NC_015188	CGAG	2	8	30370	30377	25 %	0 %	50 %	25 %	325169033
608	NC_015188	GCT	2	6	30386	30391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169033
609	NC_015188	ACG	2	6	30418	30423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169033
610	NC_015188	GGCG	2	8	30517	30524	0 %	0 %	75 %	25 %	325169033
611	NC_015188	TGGA	2	8	30557	30564	25 %	25 %	50 %	0 %	325169033
612	NC_015188	A	6	6	30600	30605	100 %	0 %	0 %	0 %	325169033
613	NC_015188	TA	3	6	30634	30639	50 %	50 %	0 %	0 %	325169033
614	NC_015188	A	6	6	30654	30659	100 %	0 %	0 %	0 %	325169033
615	NC_015188	ACG	2	6	30945	30950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169034
616	NC_015188	GCC	2	6	30959	30964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169034
617	NC_015188	GCG	2	6	31011	31016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325169034
618	NC_015188	CCGTT	2	10	31028	31037	0 %	40 %	20 %	40 %	325169034
619	NC_015188	GC	3	6	31043	31048	0 %	0 %	50 %	50 %	325169034
620	NC_015188	CGC	2	6	31125	31130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169034
621	NC_015188	GGC	2	6	31147	31152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325169034
622	NC_015188	GCCA	2	8	31163	31170	25 %	0 %	25 %	50 %	325169034
623	NC_015188	GC	3	6	31255	31260	0 %	0 %	50 %	50 %	325169034
624	NC_015188	CGC	2	6	31299	31304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169034
625	NC_015188	GGA	2	6	31337	31342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325169034
626	NC_015188	TCG	2	6	31383	31388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169034
627	NC_015188	TGT	2	6	31477	31482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325169034
628	NC_015188	TCG	2	6	31515	31520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169034
629	NC_015188	CGA	2	6	31555	31560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169034
630	NC_015188	ACC	2	6	31599	31604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325169034
631	NC_015188	GCG	2	6	31620	31625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325169034
632	NC_015188	AGA	2	6	31639	31644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325169034
633	NC_015188	CATC	2	8	31699	31706	25 %	25 %	0 %	50 %	325169034
634	NC_015188	CGCT	2	8	31793	31800	0 %	25 %	25 %	50 %	325169034
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650	NC_015188	CCA	2	6	33131	33136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325169035
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682	NC_015188	AAT	2	6	34497	34502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325169037
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746	NC_015188	AACG	2	8	37889	37896	50 %	0 %	25 %	25 %	325169042
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750	NC_015188	CTTC	2	8	37966	37973	0 %	50 %	0 %	50 %	325169042
751	NC_015188	ACA	2	6	37999	38004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325169042
752	NC_015188	TACG	2	8	38027	38034	25 %	25 %	25 %	25 %	325169042
753	NC_015188	CTT	2	6	38039	38044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325169042
754	NC_015188	CAG	2	6	38072	38077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169042
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